给排水科学与工程系成立于2015年，是重庆市优秀基层教学组织、中国勘察设计协会水系统工程与技术分会理事单位、中国水协给排水工程教育专业委员会委员单位、中国水利学会城市水利专业委员会会员单位、重庆市勘察设计协会会员单位、重庆市环境科学学会会员单位、虚拟仿真实验教学创新联盟会员单位，现有专任教师18人，实验教师2人，师资队伍博士学位比例100%，与澳大利亚蒙纳仕大学、新南威尔士大学、美国密苏里科技大学、瑞典斯德哥尔摩大学、哈尔滨工业大学、重庆大学、中国科学院重庆绿色智能技术研究院等在水生态环境领域有重要影响的高校和科研机构保持密切合作关系。 

系部设置给排水科学与工程本科专业，2007年开始招收市政工程硕士研究生，2009年开始招收本科生，现有全日制普通本科生400余人，硕士研究生100余人。专业依托土木工程（第四轮学科评估B+）和水利工程（重庆市重点学科和一流学科）一级学科博士点、环境科学与工程一级学科硕士点以及土木水利专业学位点（市政工程方向）不断发展。2019年入选重庆市高等学校“一流专业”建设点和重庆市智慧城市学科群（智慧城市水务），2021年给排水科学与工程专业首次通过住建部专业评估（认证），2022年入选重庆市智慧城市学科群（城市生态环境智能管理）、智能水利学科群（水灾害智能预测预警）。

给排水科学与工程系研究领域主要包括城市内涝与智慧水务、次级河流水污染防控与生态修复、河流生态学与生境营造技术等三个方向，培养从事给排水领域的规划与设计、施工与管理等方面工作的高素质应用型人才，致力服务成渝地区双城经济圈建设、长江经济带绿色发展大局。