重庆市航运工程技术研究中心依托重庆交通大学，于2004年11月经重庆市科委批准成立。中心建设目标是立足重庆市航运工程、面向全国和世界水运工程建设，充分发挥重庆航运的地域优势、行业优势和人才优势，建设具有一流水平的航运工程技术研究基地。

中心占地面积约120亩，建筑面积1.73万m²，已建有水工、航道、三峡、渠化、港工结构、枢纽通航、工程仿真、岩土工程等8个实验厅，实验厅总建筑面积约1.8万m²，并拥有占地面积约4万m²的大型实验场。中心是西南地区唯一设施完善的内河航运试验研发基地，同时也是全国规模最大的内河航运工程技术研究基地。

中心拥有优越的航运工程研发条件。配置有PIV流速仪、变坡水槽、声学多普勒流速仪（ADV）、激光颗粒粒度分析仪、不规则造波系统、港航工程结构实验系统等实验仪器设备共计1645台套，设备总值达6000万元，其中20万元以上的大型设备78台套，大型设备入网8台。

中心现有固定研发人员64人，其中高级职称46人，新世纪“百千万人才工程”国家级人选2人，重庆市学术技术带头人7人，具有博士学位研究人员25人。

中心的研发工作重点：航道工程整治技术研究、内河港口码头工程新技术新结构和新材料研究、航电枢纽工程技术研究、内河及库区航运环境工程综合治理研究，各研究方向均达到国内、国际领先水平。