国家内河航道整治工程技术研究中心（以下简称中心）于2011年1月由科学技术部批准组建，中心依托重庆交通大学和长江航道局共同建设和运行。中心在2014年、2016年两次全国评估获得优秀。

重庆交通大学和长江航道局是我国最早从事内河整治工程技术研究与应用的高校和事业单位，两家单位产学研用相结合，优势互补，拥有国内一流的工程技术研究开发、设计和试验专业人才队伍，科研基础设施和实（试）验条件完备。中心技术委员会由中国科学院、工程院6名院士及行业知名专家20人组成。组建了300余人的研发队伍，其中国家级人才6人、省部级人才32人。中心成立以来，获得国家级科技奖励8项，省部级特等奖、一等奖25项；主编、参编国家和行业标准34项。中心试验基地500余亩，拥有仪器设备1000余台套。

中心围绕生态航道、智能航道及港口和枢纽通航三大研究方向开展科技攻关，承担“长江上游航运开发关键技术研究”、“长江黄金航道整治技术研究与示范”等国家、省部级科技项目300余项、重大水运工程项目研究500余项，突破了一批关键技术，取得了显著的社会经济效益，相关成果成功应用于长江、西江、澜沧江等全国80%以上的内河可通航河流航运开发。

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