重庆交通大学港口航道与海岸工程专业创建于1960年，是我国最早举办的港口航道与海岸工程专业之一。2007年被评为重庆市特色专业，2009年被评为国家5级特色专业、并获批为第一批国家级人才培养模式创新实验区，2011年入选教育部“卓越工程师教育培养计划”试点专业，2013年入选重庆市“三特行动计划”首批特色专业建设点，2014年首次通过全国工程教育专业认证，2017年获批为交通运输部港口与航道工程基础设施建养技术创新人才培养示范基地，2017年顺利通过全国工程教育专业认证复评工作，2018年被评为重庆市“一流专业”，2019年获批国家一流专业建设点。

本专业依托国家内河航道整治工程技术研究中心、水利水运工程教育部重点实验室、长江航运工程与智能航道技术省部共建协同创新中心、内河航道整治技术交通行业重点实验室、生态航道重庆市重点实验室、大学生国家工程实践教育中心等10余个国家和省部级教学科研平台。现有专业教师51人，其中高级职称34人；有国家百千万人才工程人选2人，国家有突出贡献中青年专家1人, 重庆市学术技术带头人、重庆市巴渝学者等省部级人才9人。建有“港口航道与海岸工程专业” 市级教学团队、内河航道整治工程创新团队、生态智能航道技术创新示范团队、重庆市高校黄大年式教师团队等7个创新团队。